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ATELIER 1
Écologie prédictive : la modélisation du concept à l'opérationnel
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h30 et jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h
Atelier transversal
Responsables : Yvan Lagadeuc, Michel Loreau, Nicolas Mouquet
Correspondants CSINEE : Gilles Boetsch et Josette Garnier
Objectifs : Évaluer dans quelle mesure l’écologie (au sens très large incluant évolution et le fonctionnement des écosystèmes) est devenue une science prédictive. Nous commencerons par une réflexion générale pour définir ce qu’est une science prédictive. Nous explorerons ensuite les trois facettes de la démarche scientifique : Décrire, Comprendre et Prévoir.
Mots clés : Analyse, Base de données, Biogéographie, Changements globaux, Concepts, Dynamique, Eco-informatique, Ecologie, Épidémiologie, Evolution, Ecosystèmes, Epistémologie, Mathématique, Modélisation, Meta-données, Métagénomique, Modélisation prédictive, Scénarios.

4 groupes de travail s'enchaîneront.
Groupe A : Faut-il comprendre pour prévoir (qu’est-ce qu’une science prédictive).
Animateurs : Vincent Devictor et Virginie Maris.
Groupe B : Décrire.
Animateurs : Eric Garnier, Dominique Joly et Romain Julliard.
Groupe C : Comprendre.
Animateurs : Frédéric Austerlitz, Jérôme Chave, Olivier Gimenez et Sonia Kefi
Groupe D : Prévoir.
Animateurs : Serge Morand et Wilfried Thuiller
 
ATELIER 2
Génomique
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h
Atelier transversal
Responsables : Jean-Christophe Auffray, Pierre Capy et  Bruno David
Correspondant CSINEE : Christophe Douady
Mots clés : diversité/fonction, des organismes, dynamique des génomes, diversité/fonction, métagénomique, assemblages d’espèces, transfert géniques, dynamique évolutive des relations génotype-­phénotype (épigénétique), impact évolutif des phénomènes épigénétique. nouvelles techniques de séquençage
Animateurs : Pierre Capy et Dominique Mouchiroud
 
ATELIER 3
Pour une écologie globale : connaître et comprendre la diversité des disciplines
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 16h30
Atelier transversal
Responsables : Jean-Denis Vigne et Gudrun Bornette
Correspondant CSINEE : Jean-Denis Vigne
Animateurs : Wolfgang Cramer et Thierry Tatoni
 
ATELIER 4
Changement global - Organisme - Écosystème - Humain - Macro-écologie
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h
Atelier transversal
Responsable : Stéphanie Thiébault
Correspondant CSINEE : Catherine Kuzucuoglu
Mots clés : le changement climatique (paramètres, variabilité, extrêmes); concepts pour une prise de décision (impacts, adaptation, mitigation, vulnérabilité, résilience, indicateurs, détection/attribution, risque, incertitude, services écosystémiques); les apports de l’histoire (changements globaux et civilisations anciennes); impacts sur les écosystèmes marins et terrestres (biodiversité, acidification, pêches, forêts, eau douce, littoral, montagnes, sols), sur les anthroposystèmes (agriculture, villes, tourisme, usage, occupation des sols); impacts sur la santé et la sécurité humaines  (qualité de l’air, malnutrition, épidémies, migrations, conflits, inégalités); politiques publiques, normes, négociations internationales; les instruments de l’adaptation/mitigation : ingénierie, instruments économiques, développement durable.
Animateurs : Isabelle Chuine, Josette Garnier, Joël Guiot et Alain Nadaï.
 
ATELIER 5
Évolution humaine biologique et culturelle
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 16h30
Atelier transversal
Responsables : Jean-Christophe Auffray et Jean-Denis Vigne
Correspondants CSINEE : Jean-Christophe Auffray et Gilles Boetsch
Animateurs : Bruno Maureille et Michel Raymond
 
ATELIER 6
Hérédité génétique et non génétique
Mercredi 24 octobre de 17h à 19h30
Atelier transversal
Responsable : Jean-Christophe Auffray
Correspondant CSINEE : Jean-Pierre Feral
Mots clés : Génétique, Epigénétique, Effets parentaux, Hérédité écologique, Construction de niche, Culture animale, Flux d'information (= généralisation de la notion de flux de gènes).
Animateurs : Étienne Danchin et Odile Petit
 
ATELIER 7
Écologie, évolution, santé, biodiversité
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h
Atelier transversal
Responsable : François Renaud
Correspondant CSINEE : Marie Gaille
Mots clés : médecine évolutive, pathogènes émergents, faune sauvage, zoonoses, anthropisation, cancer, sénescence, mondialisation des échanges, adaptations locales, Evolution de la Virulence, Paléo-médecine
Animateur : François Renaud
 
ATELIER 8
Santé - Société
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 13h
Atelier transversal
Responsable : Gilles Boetsch
Correspondant CSINEE : Lamine Gueye
Mots clés : Eco-épidémiologie, maladies chroniques non transmissibles, géographie de la santé, écotoxicologie, alimentation humaine
Animateurs : Gilles Boetsch et Anne-Marie Guihard-Costa
 
ATELIER 9
Services écosystémiques - Représentation de la nature et de l'environnement
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h
Atelier transversal
Responsables : Jérôme Casas et Franck Courchamp
Correspondants CSINEE : Thierry Dutoit et Virginie Maris
Mots clés : service écosystémique, fonctions écosystémiques, stochasticité/imprévisibilité des processus écologiques et acceptabilité sociale, systèmes socioécologiques, économie de l’environnement, conservation, restauration, ingénierie écologique, systèmes de valeur, histoire et épistémologie des sciences de l’environnement, droit, économie, politique, philosophie, éthique de l’environnement, demande sociétale, stratégies sociétales, science et société
Animateurs : Denis Couvet, Marie Gaille et Sandra Lavorel
 
ATELIER 10
Réseaux d'interactions et rétroactions : approches systémiques
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h
Atelier transversal
Responsables : Jérôme Casas, Franck Courchamp et Sylvain Lamare
Correspondants CSINEE : Denis Allemand, Josette Garnier et Nadine Le Bris
Animateurs : Didier Bouchon, Jean-Luc Probst, Pierre Ribdtein et Jacques Roy
 
ATELIER 11
Mer
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 19h
Atelier transversal
Responsable : Bruno David
Correspondants CSINEE : Denis Allemand, Sylvie Dufour, Jean-Pierre Féral, Josette Garnier, Didier Jouffre, Nadine Le Bris et Alain Mahric.
Atelier ayant pour but de finaliser la prospective mer.
 
ATELIER 12
Eco-évo-dévo-paléo
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h30
Atelier spécifique
Responsable : Jean-Christophe Auffray
Correspondant CSINEE : Patricia Gibert
Mots clés : Plasticité phénotypique, adaptations, épigénétique, développement,  anatomie fonctionnelle, lignées évolutives, génétique quantitative, évolution des traits biomécaniques…
Animateurs : Didier Casane, Philippe Janvier et Sabrina Renaud. 
 
ATELIER 13
Sexe et évolution
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h
Atelier spécifique
Responsable : Jean-Christophe Auffray
Correspondant CSINEE : Gilles Boetsch
Mots clés : stratégie de reproduction, sélection sexuelle, senescence, couts, dégénerescence du chromosome Y, conversion génique, perte de gènes,  signaux comportementaux, visuels, olfactifs et auditifs, fertilité, multiplication végétative et plasticité phénotypique, quantification/signification de la diversité génétique chez les organismes clonaux….
Animateurs : Brigitte Crouau-Roy et Fréderic Veyrunes
 
ATELIER 14
Écologie tropicale
Mercredi 24 octobre de 17h à 19h
Atelier spécifique
Responsable : Doyle McKey
Correspondants CSINEE : Denis Allemand et Didier Jouffre
Mots clés : Biodiversité/stabilité des écosystèmes tropicaux. Community disassembly – écosystèmes sans analogues contemporains – hotspots – relations entre diversité biotique et diversité culturelle – « Biome shifts »
Animateurs : Jérôme Chave et Pierre-Michel Forget
 
ATELIER 15
Systématique, phylogénie
Mercredi 24 octobre de 17h à 19h30
Atelier spécifique
Responsables : Philippe Grandcolas (J. Casas + F. Courchamp)
Correspondants CSINEE : Christophe Douady et Jean-Pierre Féral
Mots clés et Animateurs :
•    Analyse phylogénétique et évolution du génome, : Vincent Daubin
•    Analyse phylogénétique et écologie des communautés : Jérôme Chave
•    Les gradients de diversité et la balance spéciation-extinction dans une perspective phylogénétique : Gaël Kergoat
•    Identification des espèces, barcoding moléculaire : état des lieux : Sarah Samadi et Régine Vignes-Lebbe
 
ATELIER 16
Systèmes culturels, stratégies et pratiques d'exploitation, de contrôle et de gestion de l'environnement
Mercredi 24 octobre de 13h30 à 16h30
Atelier spécifique
Responsable : Jean-Denis Vigne
Correspondant CSINEE : Catherine Kuzucuoglu
Animateurs : Didier Binder et Yildiz Thomas

 
ATELIER 17
Domestication, agrobiodiversité
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h30
Atelier spécifique
Responsable : Jean-Denis Vigne
Mots clés : Processus et rythmes de domestication, Mécanismes biologiques de la domestication, Expérimentation in natura, Anthropophilie, Commensalisme, Adventices, Acclimatation, Marronnage, Origine des agro-biodiversités, Co-développement, Co-évolution, Patrimoines zoo- et phytotechniques, Lignées domestiques, Races, OGM, « NAC » (nouveaux animaux de compagnie,  Phytotechnie, Zootechnie, Aquaculture, Production et alimentation, Zoonoses et santé, Conservation des denrées
Animateurs : Jean-Fredéric Terral et Jean-Denis Vigne
 
ATELIER 18
Socio-écosystèmes urbains
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h30
Atelier spécifique
Responsable : Jean-Denis Vigne
Correspondants CSINEE : Gilles Boetch
Animateurs : Magalie Deschamps-Cottin et Jean-Yves Toussaint
 
ATELIER 19
Environnements quaternaires non anthropisés ou peu anthropisés : interactions Homme-environnement sur le long terme
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h
Atelier spécifique
Responsable : Jean-Denis Vigne
Correspondant CSINEE : Catherine Kuzucuoglu
Animateurs : Pierre Antoine, Jean-Jacques Bahain et Pascal Bertran

ATELIER 20
Prospective priorités en recherche en écologie
Jeudi 25 octobre de 11h à 13h
Atelier spécifique
Responsables et intervenants : Jérôme Casas et Franck Courchamp
Correspondant CSINEE : Jean-Pierre FERAL
Mots clés : méthode Sutherland, consensus building, horizon scanning, méthode participative, experts, scénarios, prévisions, régionalisation
 
ATELIER 21
Prospective priorités en recherche en écophysiologie animale
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h
Atelier spécifique
Responsable : Stéphane Blanc
Correspondants CSINEE : Sylvie Dufour et Marie Gaille
Mots clés : Adaptabilité aux environnements changeants : plasticité et flexibilité phénotypique, stress et allostasie, écotoxicologie; Physiologie des grandes fonctions et stratégies adaptatives : gestions des réserves énergétiques, modulation de la dépense énergétique, assimilation, locomotion, thermorégulation; contrôle physiologique des traits d’histoire de vie : reproduction, performance, vieillissement, acquisition des ressources; challenges méthodologiques; retombées biomédicales des modèles animaux exotiques.
Animateurs : Xavier Bonnet et Yves Handrich
 
ATELIER 22
Prospective priorités en recherche en écotoxicologie
Jeudi 25 octobre de 8h30 à 11h
Atelier spécifique
Responsables : Cécile Bernard et Pascale Bauda, Gudrun Bornette.
Correspondants CSINEE : Nadine Le Bris
Mots clés : polluants émergents, pollutions mixtes, expositions chroniques aux faibles doses, changements d’échelles (organisation biologique, échelles spatiales), mécanismes d’action, modélisation, érosion de la biodiversité, impact sur les services écosystémiques, outils omiques….
Animateurs : Cécile Bernard et Laure Giamberini